Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Sumo3Q9Z172 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sumo3Q9Z172 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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