Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema4fQ9Z123 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms