Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn13Q9Z0S4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms