Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clip2Q9Z0H8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip2Q9Z0H8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms