Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbp2Q9Z0E6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms