Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pacsin2Q9WVE8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pacsin2Q9WVE8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms