Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Katna1Q9WV86 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms