Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme3Q9WV85 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms