Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp1a4Q9WV27 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1a4Q9WV27 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp1a4Q9WV27 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms