Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrf1Q9WU00 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrf1Q9WU00 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms