Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp18Q9WTV6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp18Q9WTV6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms