Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trpc2Q9R244 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms