Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed2Q9R0Q3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms