Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcm1Q9R0L6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcm1Q9R0L6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms