Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp11cQ9QZW0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms