Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf4Q9QZS2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf4Q9QZS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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