Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms