Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ChmlQ9QZD5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChmlQ9QZD5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChmlQ9QZD5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms