Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn8Q9QZ49 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn8Q9QZ49 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms