Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms