Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VapbQ9QY76 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VapbQ9QY76 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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