Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1nQ9QXV0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk1nQ9QXV0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms