Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Limd1Q9QXD8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Limd1Q9QXD8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms