Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Homer2Q9QWW1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms