Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phc2Q9QWH1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phc2Q9QWH1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms