Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdcQ9QW08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms