Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dkk3Q9QUN9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dkk3Q9QUN9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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