Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csnk1eQ9JMK2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms