Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rabgef1Q9JM13 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rabgef1Q9JM13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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