Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cabp1Q9JLK7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms