Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LitafQ9JLJ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LitafQ9JLJ0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LitafQ9JLJ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LitafQ9JLJ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LitafQ9JLJ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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LitafQ9JLJ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LitafQ9JLJ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms