Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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