Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmod4Q9JLH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tmod4Q9JLH8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tmod4Q9JLH8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmod4Q9JLH8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms