Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd2l2Q9JLG4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms