Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nectin3Q9JLB9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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