Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upk3aQ9JKX8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Upk3aQ9JKX8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms