Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Irx5Q9JKQ4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms