Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pole3Q9JKP7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pole3Q9JKP7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms