Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx6Q9JKK1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms