Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp39a1Q9JKJ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms