Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnga3Q9JJZ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnga3Q9JJZ8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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