Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddx20Q9JJY4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx20Q9JJY4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms