Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Bco1Q9JJS6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bco1Q9JJS6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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