Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc86Q9JJ89 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc86Q9JJ89 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc86Q9JJ89 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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