Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacna1fQ9JIS7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1fQ9JIS7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms