Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms