Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tcirg1Q9JHF5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tcirg1Q9JHF5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms