Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim39Q9ESN2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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