Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1Q9ESG2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms