Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx6Q9ER75 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irx6Q9ER75 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms